Il territorio rurale corrisponde alle parti del territorio comunale esterne al perimetro del territorio urbanizzato individuato dal Piano Strutturale alla tavola ST 03 "Individuazione del perimetro del territorio urbanizzato", scala 1:15.000. Il Piano Strutturale articola, in relazione ai differenti caratteri del territorio rurale e al fine del conseguimento dei propri obiettivi e di quelli del Piano di Indirizzo Territoriale con valenza di Piano Paesaggistico Regionale, il territorio rurale in sei UTOE. All'interno di alcune UTOE del territorio rurale il Piano Strutturale individua ulteriori aree che, pur ospitando funzioni non agricole, non costituiscono territorio urbanizzato. Tali ambiti corrispondono ai nuclei abitati di Limoncino, Valle Benedetta e Condotti vecchi, al complesso del carcere sito in località Le Sughere, ad aree a destinazione produttiva- artigianale già individuate dal Regolamento urbanistico e sulle quali sono insediate attività. Tale insieme di aree è individuato graficamente alla tavola STS02 "Parti di città - UTOE", scala 1:15.000. Le UTOE del territorio rurale individuati dal Piano Strutturale sono graficamente rappresentati alla tavola STS 01 "Parti di città - UTOE", in scala 1:15.000, e descritte nelle schede contenute nel presente documento sono le seguenti:

1. 17. Agricoltura
2. 18. Aree con prevalenza di agricoltura amatoriale
3. 19. Aree tutela dei Monti livornesi
4. 20. Aree di speciale valore naturalistico e paesaggistico
5. 21. Costa di Calafuria
6. 22. Isola di Gorgona
7. 23. Secche della Meloria.